Sebelum meninggalkan Rumah Putih pada Januari 1961, Presiden Eisenhower menganjurkan agar kekuatan ketenteraan Amerika tetap dipelihara, tetapi juga memperingatkan bahwa pengeluaran anggaran belanja yang sangat besar dan terus menerus untuk keperluan ketenteraan dapat membahayakan cara hidup rakyat Amerika. Dalam kata perpisahannya, beliau berdoa semoga semua bangsa di dunia ini hidup bersama dalam damai, berdasarkan rasa kasih sayang dan saling menghargai antara sesama manusia.

Eisenhower meninggal dunia akibat serangan jantung pada 28 Mac 1969 di Washington, D.C.. Beliau meninggalkan isterinya dan seorang anak lelaki yang sewaktu itu sedang bertugas sebagai Duta Besar Amerika di Belgium.